Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SGF29Q96ES7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGF29Q96ES7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGF29Q96ES7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms