Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC126Q96EE4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC126Q96EE4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC126Q96EE4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms