Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUS1Q96E22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUS1Q96E22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUS1Q96E22 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms