Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL29Q96CT2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL29Q96CT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL29Q96CT2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL29Q96CT2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms