Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VTI1AQ96AJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VTI1AQ96AJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VTI1AQ96AJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms