Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC17Q96AE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC17Q96AE7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC17Q96AE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms