Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYAP1Q96A49 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYAP1Q96A49 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms