Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC38A4Q969I6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC38A4Q969I6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms