Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP13Q92995 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP13Q92995 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP13Q92995 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP13Q92995 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
USP13Q92995 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP13Q92995 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP13Q92995 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP13Q92995 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP13Q92995 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP13Q92995 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP13Q92995 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP13Q92995 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP13Q92995 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP13Q92995 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP13Q92995 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP13Q92995 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP13Q92995 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP13Q92995 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP13Q92995 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP13Q92995 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP13Q92995 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP13Q92995 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP13Q92995 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP13Q92995 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP13Q92995 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP13Q92995 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP13Q92995 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP13Q92995 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP13Q92995 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP13Q92995 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP13Q92995 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP13Q92995 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP13Q92995 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP13Q92995 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP13Q92995 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP13Q92995 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms