Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLP1Q92989 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLP1Q92989 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLP1Q92989 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms