Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRUQ92729 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTPRUQ92729 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms