Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM1Q92611 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EDEM1Q92611 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EDEM1Q92611 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms