Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG4AQ8WYN0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG4AQ8WYN0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG4AQ8WYN0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms