Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RUFY2Q8WXA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RUFY2Q8WXA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms