Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTSF1Q8WW33 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GTSF1Q8WW33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms