Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR60Q8WVS4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR60Q8WVS4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WDR60Q8WVS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms