Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC107Q8WV48 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC107Q8WV48 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms