Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY3

PRUNE2, Protein prune homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRUNE2Q8WUY3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRUNE2Q8WUY3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRUNE2Q8WUY3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRUNE2Q8WUY3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms