Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG1Q8WTW3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COG1Q8WTW3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms