Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SSH3Q8TE77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SSH3Q8TE77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSH3Q8TE77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms