Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
DDX54Q8TDD1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DDX54Q8TDD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DDX54Q8TDD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDX54Q8TDD1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms