Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEK9Q8TD19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NEK9Q8TD19 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NEK9Q8TD19 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms