Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RP9Q8TA86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RP9Q8TA86 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RP9Q8TA86 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms