Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RNF214Q8ND24 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RNF214Q8ND24 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms