Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL3Q8ND23 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CARMIL3Q8ND23 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL3Q8ND23 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms