Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG8Q8ND04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG8Q8ND04 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG8Q8ND04 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMG8Q8ND04 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms