Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD1Q8NBU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATAD1Q8NBU5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms