Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPC24Q8NBT2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPC24Q8NBT2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPC24Q8NBT2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
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