Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANKRD42Q8N9B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms