Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC9Q8N567 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC9Q8N567 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms