Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SVOPQ8N4V2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SVOPQ8N4V2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SVOPQ8N4V2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms