Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NINQ8N4C6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NINQ8N4C6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NINQ8N4C6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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