Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO39Q8N4B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO39Q8N4B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO39Q8N4B4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms