Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3L3

TXLNB, Beta-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNBQ8N3L3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TXLNBQ8N3L3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TXLNBQ8N3L3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TXLNBQ8N3L3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms