Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLFN12Q8IYM2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLFN12Q8IYM2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLFN12Q8IYM2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms