Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD2Q8IXW0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD2Q8IXW0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD2Q8IXW0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms