Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLF2Q8IX21 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLF2Q8IX21 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLF2Q8IX21 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms