Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM42Q8IWZ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM42Q8IWZ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM42Q8IWZ5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms