Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC71Q8IV32 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC71Q8IV32 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms