Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF13Q86YI8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF13Q86YI8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF13Q86YI8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms