Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHSY1Q86X52 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHSY1Q86X52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHSY1Q86X52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms