Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4DQ86TL0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATG4DQ86TL0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG4DQ86TL0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms