Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATL1Q86TB9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATL1Q86TB9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PATL1Q86TB9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms