Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO2Q7Z6W1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO2Q7Z6W1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO2Q7Z6W1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO2Q7Z6W1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms