Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD4Q76G19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDZD4Q76G19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD4Q76G19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms