Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SMIM5Q71RC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
SMIM5Q71RC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMIM5Q71RC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms