Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYS1Q717R9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYS1Q717R9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYS1Q717R9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms