Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN12Q6ZSI9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAPN12Q6ZSI9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN12Q6ZSI9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms