Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC129Q6ZRS4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC129Q6ZRS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC129Q6ZRS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms