Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDZRN4Q6ZMN7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDZRN4Q6ZMN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDZRN4Q6ZMN7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms